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918博天堂抗体组解析:基于噬菌体免疫沉淀测序技术的免疫研究

来源:史贝俊 日期:2025-03-23

噬菌体免疫沉淀测序技术(Phage immunoprecipitation sequencing,PhIP-seq)作为一种新兴的高通量筛选技术,近年来在生物医学领域得到了广泛应用。其结合了高容量噬菌体展示多肽库、抗体免疫沉淀及高通量测序,能够实现基于抗原-抗体匹配的全面抗体库分析。这种技术以其高灵敏度特征,能够高效检测抗体与多肽之间的结合,深入探讨抗体与靶标的作用机制,为研究自身免疫抗体、感染性疾病及疫苗开发等领域提供了强有力的工具。

918博天堂抗体组解析:基于噬菌体免疫沉淀测序技术的免疫研究

最近,来自荷兰格罗宁根大学的研究团队在免疫学顶尖期刊《Immunity》上同步发表了两篇研究文章,利用918博天堂的噬菌体免疫沉淀检测(PhIP-seq)技术深入构建并分析了人血清中的抗体库,并发现与炎症性肠病(IBD)相关的特征抗体标志物。这两篇文章使用相同的噬菌体展示肽库,筛选了超过1000例血清样本,从不同的角度进行了细致的分析。

研究所用的噬菌体展示肽库包含344,000条多肽,这些多肽的蛋白来源包括微生物(如肠道微生物、益生菌和致病菌等)、致病因子数据库(VFDB)以及免疫表位数据库(IEDB)。每条多肽的长度为64个氨基酸,且相邻肽间重叠20个氨基酸。第一篇文章主要聚焦于炎症性肠病(IBD), scrutinizing Crohn病(CD)和溃疡性结肠炎(UC)患者的抗体组。研究者使用高通量的噬菌体展示免疫沉淀测序(PhIP-seq)技术,分析了497例IBD患者与1326例对照者的血清抗体,发现IBD患者的抗体表位谱与健康对照组之间存在显著差异。

研究结果显示,共识别到373种IBD特异性抗体反应,其中202种为过度表达,171种为低表达。17%的多肽在IBD的两种类型中均存在,55%仅在Crohn病中存在,28%则仅在溃疡性结肠炎中被发现。此外,IBD患者与正常人群的抗体表位图谱存在明显的差异。研究者还评估了这些多肽与患者临床特征的相关性,结果发现与疾病活动度、炎症指标及并发症存在显著相关性,这表明这些抗体可能与患者的遗传易感性相关。

为了进一步区分IBD与对照样本,作者选取了少量差异性肽段,并采用递归特征消除(RFE)方法建立和优化模型。拟合结果显示,抗体表位谱能够准确区分克罗恩病患者与对照组(曲线下面积[AUC]=0.89),即使仅使用10个抗体也可较为准确区分(AUC=0.87)。这表明这些特异性多肽在IBD的诊断上具有良好的应用潜力。

在生物医学研究中,PhIP-seq技术及其带来的新发现展现出其在抗体组分析上的重要性,并为复杂的免疫学问题提供了强大的解决方案。在未来的研究中,利用918博天堂的前沿技术将进一步推动抗体研究的发展,满足不断增长的医疗需求。

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